MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Puno135 chromosome

Total Repeats: 34526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017379	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	385229316
2	NC_017379	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	385229316
3	NC_017379	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229316
4	NC_017379	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	385229316
5	NC_017379	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229316
6	NC_017379	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	385229316
7	NC_017379	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	385229316
8	NC_017379	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229316
9	NC_017379	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	385229316
10	NC_017379	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229317
11	NC_017379	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	385229317
12	NC_017379	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229317
13	NC_017379	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229317
14	NC_017379	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	385229317
15	NC_017379	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229317
16	NC_017379	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385229317
17	NC_017379	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229317
18	NC_017379	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385229318
19	NC_017379	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229318
20	NC_017379	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229318
21	NC_017379	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229318
22	NC_017379	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229318
23	NC_017379	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229318
24	NC_017379	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	385229318
25	NC_017379	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	385229318
26	NC_017379	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	385229318
27	NC_017379	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	385229318
28	NC_017379	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385229318
29	NC_017379	TGCT	2	8	1454	1461	0 %	50 %	25 %	25 %	385229318
30	NC_017379	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	385229318
31	NC_017379	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385229318
32	NC_017379	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229318
33	NC_017379	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229318
34	NC_017379	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229318
35	NC_017379	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229319
36	NC_017379	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	385229319
37	NC_017379	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385229319
38	NC_017379	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	385229319
39	NC_017379	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229319
40	NC_017379	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385229319
41	NC_017379	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	385229319
42	NC_017379	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229319
43	NC_017379	CA	3	6	1913	1918	50 %	0 %	0 %	50 %	385229319
44	NC_017379	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	385229319
45	NC_017379	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229319
46	NC_017379	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229319
47	NC_017379	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229319
48	NC_017379	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	385229319
49	NC_017379	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229319
50	NC_017379	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229319
51	NC_017379	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385229319
52	NC_017379	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	385229319
53	NC_017379	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017379	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	385229320
55	NC_017379	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385229320
56	NC_017379	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	385229320
57	NC_017379	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	385229320
58	NC_017379	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229320
59	NC_017379	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	385229320
60	NC_017379	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	385229320
61	NC_017379	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	385229320
62	NC_017379	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229320
63	NC_017379	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	385229320
64	NC_017379	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229320
65	NC_017379	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229320
66	NC_017379	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229320
67	NC_017379	TTG	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229321
68	NC_017379	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	385229321
69	NC_017379	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	385229321
70	NC_017379	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	385229321
71	NC_017379	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	385229321
72	NC_017379	AGC	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229321
73	NC_017379	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229321
74	NC_017379	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229321
75	NC_017379	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385229321
76	NC_017379	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	385229321
77	NC_017379	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	385229321
78	NC_017379	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229321
79	NC_017379	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385229321
80	NC_017379	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017379	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017379	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017379	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017379	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017379	GTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017379	ACC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017379	GGT	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017379	A	7	7	4581	4587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017379	T	8	8	4601	4608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017379	AAT	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017379	A	6	6	4758	4763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017379	ATT	2	6	4792	4797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017379	T	7	7	4809	4815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017379	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017379	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017379	TGT	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017379	TTTTA	2	10	4899	4908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017379	TC	3	6	4944	4949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017379	C	6	6	4972	4977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_017379	A	9	9	4978	4986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017379	A	7	7	4995	5001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017379	A	6	6	5012	5017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017379	A	6	6	5041	5046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017379	GCTT	2	8	5208	5215	0 %	50 %	25 %	25 %	385229322
105	NC_017379	T	6	6	5214	5219	0 %	100 %	0 %	0 %	385229322
106	NC_017379	CATT	2	8	5279	5286	25 %	50 %	0 %	25 %	385229322
107	NC_017379	ATT	2	6	5301	5306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229322
108	NC_017379	A	6	6	5511	5516	100 %	0 %	0 %	0 %	385229322
109	NC_017379	C	6	6	5531	5536	0 %	0 %	0 %	100 %	385229322
110	NC_017379	A	6	6	5553	5558	100 %	0 %	0 %	0 %	385229322
111	NC_017379	CATT	2	8	5588	5595	25 %	50 %	0 %	25 %	385229322
112	NC_017379	GTT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
113	NC_017379	TAA	2	6	5670	5675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229322
114	NC_017379	TTA	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229322
115	NC_017379	GTG	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229322
116	NC_017379	GC	3	6	5859	5864	0 %	0 %	50 %	50 %	385229322
117	NC_017379	T	6	6	6066	6071	0 %	100 %	0 %	0 %	385229322
118	NC_017379	AGA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229322
119	NC_017379	GCG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385229322
120	NC_017379	TTGCT	2	10	6187	6196	0 %	60 %	20 %	20 %	385229322
121	NC_017379	AC	3	6	6288	6293	50 %	0 %	0 %	50 %	385229322
122	NC_017379	GC	3	6	6320	6325	0 %	0 %	50 %	50 %	385229322
123	NC_017379	TGATTG	2	12	6340	6351	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385229322
124	NC_017379	CTT	2	6	6395	6400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229322
125	NC_017379	GTT	2	6	6417	6422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
126	NC_017379	AGT	5	15	6423	6437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229322
127	NC_017379	TGT	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
128	NC_017379	TTG	2	6	6531	6536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
129	NC_017379	CAT	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229322
130	NC_017379	GTT	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
131	NC_017379	CTGG	2	8	6647	6654	0 %	25 %	50 %	25 %	385229322
132	NC_017379	TGA	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229322
133	NC_017379	CCG	2	6	6734	6739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385229322
134	NC_017379	T	6	6	6782	6787	0 %	100 %	0 %	0 %	385229322
135	NC_017379	ATCG	2	8	6822	6829	25 %	25 %	25 %	25 %	385229322
136	NC_017379	GCT	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229322
137	NC_017379	CGTT	2	8	6857	6864	0 %	50 %	25 %	25 %	385229322
138	NC_017379	GTT	2	6	6879	6884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229322
139	NC_017379	A	6	6	6996	7001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017379	GA	9	18	7035	7052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017379	T	7	7	7062	7068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017379	TGT	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229323
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461	NC_017379	CTTT	2	8	22693	22700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_017379	GTT	2	6	25062	25067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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